HEKS leistet vor Ort Soforthilfe für die von Krieg, Gewalt und Zerstörung heimgesuchte Zivilbevölkerung, zum Beispiel in Syrien, Irak oder im Südsudan, und verteilt Lebensmittel, Hygieneartikel, Wolldecken und andere Güter des täglichen Bedarfs an besonders bedürftige Familien. Um gesellschaftliche Spannungen abzubauen, unterhält HEKS auch Projekte in Dörfern, in denen sich besonders viele intern vertriebene Familien aufhalten. So werden etwa im Irak und im Südsudan ansässige Kleinbauernfamilien und intern Vertriebene beim gemeinsamen Getreide- und Gemüseanbau unterstützt.